Wer um Yap abtaucht, wird schnell erkennen, wofür die Inseln so bekannt sind. Denn hier befindet sich eine der weltweit grössten Ansiedlung von Mantas, vor allem in der Paarungszeit von Dezember bis April. Als wäre das nicht schon genug, gesellen sich in und um die Kanäle gerne Weiss- und Schwarzspitzenhaie, wie auch graue Riffhaie dazu. An der Südspitze von Yap gibt es oft die eine oder andere Überraschung – so wurden auch schon Hochseehaie, Mondfische und sogar Orcas beobachtet.

Gesunde Korallengärten auf der Ostseite und eindrückliche Steilwände auf der Westseite der Insel sorgen für viel Abwechslung. Die Riffe beheimaten über 200 verschiedene Korallenarten. Farbige Mandarinfische, Geisterfetzenfische und Anglerfische, Nacktschnecken, wie auch Barrakudas, Büffelkopfpapageifische, Adler- und Stachelrochen und Schildkröten leben in der sehr reichhaltigen und vielfältigen Unterwasserwelt.

Das Tauchen auf Yap ist für jedes Niveau und ganzjährig geeignet. Die Sicht ist mit 40 bis 50 m meistens ausgezeichnet.